区国动办设以下科室：

    （一）综合协调科。

    （二）设施管理科       

    下属两个事业单位：

    （一）门头沟区人民防空工程事务中心

    主要职责：负责人防工程质量监督，工程验收工作；负责人防工程加固、改造工作；负责人防工程档案的建立和维护工作。
   

    （二）门头沟区人民防空通讯指挥中心

    主要职责：负责人防指挥中心自动化系统及通信设备的维护管理工作；负责全区人防系统警报的维护与管理工作。